Les cibles et stratégies innovantes dans la lutte contre l'antibiorésistances / Morgan Lambérioux ; sous la direction de Philippe Lanotte et Didier Mazel

Résumé / Abstract : La résistance croissante aux antibiotiques constitue l'une des plus grandes préoccupations en matière de santé pour le XXIe siècle. Un nombre croissant d’infections sont causées par des bactéries multi-résistantes aux antibiotiques et si aucune alternative aux antibiotiques n’est trouvée, il est estimé, qu’en 2050, les infections bactériennes deviendront la première cause de mortalité dans le monde. Face à ce défi, plusieurs approches sont envisagées pour palier à l'inefficacité potentielle des antibiotiques. Parmi elles, se démarquent les stratégies exploitant les bactériophages, les peptides antimicrobiens et de nombreuses autres molécules capable de potentialiser les traitements antibiotiques. D’autres stratégies innovantes proposent de détourner la conjugaison bactérienne pour disséminer un élément génétique capable d’éliminer spécifiquement certaines bactéries pathogènes au sein d’une population bactérienne complexe. Celles-ci reposent sur l’utilisation d’un plasmide mobilisable ou conjugatif codant un système CRISPR-Cas ou un module toxique comme une toxine bactérienne. Dans ce contexte, le projet CoKiP (Conjugative Killer Plasmid) se distingue en utilisant un plasmide conjugatif à large spectre d'hôtes pour disséminer un module toxine-intéine. L’expression de ce module est strictement contrôlée par un facteur de transcription présent exclusivement chez les bactéries pathogènes visées. L’objectif est ainsi l'élimination spécifique de Shigella spp, Salmonella enterica et Klebsiella pneumoniae

Résumé / Abstract : Growing resistance to antibiotics is one of the greatest health concerns of the 21st century. A growing number of infections are caused by bacteria that are multi-resistant to antibiotics, and if no alternative to antibiotics is found, it is estimated that by 2050 bacterial infections will become the leading cause of death in the world. Faced with this challenge, several approaches are being considered to overcome the potential ineffectiveness of antibiotics. These include strategies using bacteriophages, antimicrobial peptides and numerous other molecules capable of potentiating antibiotic treatments. Other innovative strategies involve hijacking bacterial conjugation to disseminate a genetic element capable of specifically eliminating certain pathogenic bacteria within a complex bacterial population. These strategies are based on the use of a mobilisable or conjugative plasmid encoding a CRISPR-Cas system or a toxic module such as a bacterial toxin. In this context, the CoKiP (Conjugative Killer Plasmid) project stands out by using a broad host-spectrum conjugative plasmid to disseminate a toxin-intein module. The expression of this module is strictly controlled by a transcription factor present exclusively in the target pathogenic bacteria. The aim is to specifically eliminate Shigella spp, Salmonella enterica and Klebsiella pneumoniae