Criblage de la diversité fongique marine visant à identifier de nouvelles oxydases pour les biotechnologies et le développement durable / Wissal Ben Ali ; sous la direction de Eric Record et de Tahar Mechichi

Date :

Type : Livre / Book

Type : Thèse / Thesis

Langue / Language : français / French

Catalogue Worldcat

Laccase

Biotechnologie

Développement durable

Transcriptome

Aspergillus nidulans -- Dissertation universitaire

Classification Dewey : 579

Record, Eric (Directeur de thèse / thesis advisor)

Mechichi, Tahar (19..-....) (Directeur de thèse / thesis advisor)

Maldonado Coutinho, Pedro (1965-....) (Président du jury de soutenance / praeses)

Rakotoarivonina, Harivony (1976-....) (Rapporteur de la thèse / thesis reporter)

Gargouri, Ali Faouzi (19..-....) (Rapporteur de la thèse / thesis reporter)

Gargouri-Bouzid, Radhia (19-....) (Membre du jury / opponent)

Mekmouche, Yasmina (1975-) (Membre du jury / opponent)

Aix-Marseille Université (2012-....) (Organisme de soutenance / degree-grantor)

Université de Sfax (Tunisie) (Organisme de cotutelle / degree co-grantor)

Ecole Doctorale Sciences de la Vie et de la Santé (Marseille) (Ecole doctorale associée à la thèse / doctoral school)

Biodiversité et Biotechnologie Fongiques (BBF) (Marseille) (Laboratoire associé à la thèse / thesis associated laboratory)

Résumé / Abstract : Cette étude traite l’isolement et l’identification de nouvelles souches marines pour la production de nouvelles enzymes de type laccases, pour la dégradation de colorants industriels. Cinq isolats ont montré une activité laccase potentiellement intéressante. L’identification moléculaire et morphologique de ces cinq souches sélectionnées montre qu’il s’agit de Trichoderma asperellum (T. asperellum1,2 and 3), Aspergillus nidulans et Stemphylium lucomagnoense. Nous nous sommes intéressés dans la première partie à la souche T.asperellum1 qui a généré une forte activité laccase. Nous avons étudié les paramètres de croissance de cette souche pour améliorer son activité laccase et nous avons aussi testé son efficacité à décolorer différents types des colorants synthétiques. Nous avons étudié les processus de dégradation de la biomasse lignocellulosique des cinq champignons marins précédemment isolés, en mesurant leurs activités lignocellulolytiques sur des surnageants de cultures des champignons mis en culture avec de la paille de blé ou de l’herbe marine. La présence de sel dans le milieu de culture a été également étudiée dans cette partie. S.lucomagnoense a été sélectionné comme modèle pour étudier l’adaptation physiologique au substrat lignocellulosique et à son environnement marin par une approche protéomique couplée au séquençage du transcriptome. Enfin, nous avons effectué une expression hétérologue chez Aspergillus niger d’un gène (SlLac2) codant pour une laccase Nous avons purifié et étudié les caractéristiques physico-chimiques et cinétiques de cette enzyme et discuté de ces caractéristiques avec celles disponibles dans la littérature

Résumé / Abstract : This study deals with the isolation and identification of new marine strains for the production of new laccase type enzymes for the degradation of industrial dyes. Five isolates showed a potentially interesting laccase activity. The molecular and morphological identification of these five selected strains shows that they are Trichoderma asperellum (T. asperellum1,2 and 3), Aspergillus nidulans and Stemphylium lucomagnoense. In the first part, we were interested T. asperellum1 strain which has generated a high laccase activity. We studied the growth parameters of this strain to improve its laccase activity and we also tested its effectiveness in bleaching different types of synthetic dyes. We studied the processes of degradation of the lignocellulosic biomass of the five previously isolated marine fungi, by measuring their lignocellulolytic activities on culture supernatants of the fungi cultured with wheat straw or sea grass. The presence of salt in the culture medium was also studied in this section. S.lucomagnoense was selected as a model to study the physiological adaptation to the lignocellulosic substrate and its marine environment by a proteomic approach coupled to transcriptome sequencing. Finally, we performed heterologous expression in Aspergillus niger of a gene (SlLac2) coding for a laccase. We purified and studied the physico-chemical and kinetic characteristics of this enzyme and discussed these characteristics with those available in the literature.