Étude structurale d'un système d'efflux tripartite bactérien MexAB-OprM impliqué dans la résistance aux antibiotiques chez Pseudomonas aeruginosa. / Dimitri Salvador ; sous la direction de Olivier Lambert

Date :

Type : Livre / Book

Type : Thèse / Thesis

Langue / Language : français / French

Catalogue Worldcat

Pseudomonas aeruginosa

Résistance aux antibiotiques

Protéines membranaires

Transport biologique actif

Lambert, Olivier (19..-.... ; enseignant-chercheur) (Directeur de thèse / thesis advisor)

Alves, Isabel D. (19..-.... ; biologiste) (Président du jury de soutenance / praeses)

Mus-Veteau, Isabelle (19..-....) (Rapporteur de la thèse / thesis reporter)

Roussel, Alain (1965-.... ; Directeur de recherche au CNRS) (Rapporteur de la thèse / thesis reporter)

Lionne, Corinne (chercheur en biologie moléculaire) (Membre du jury / opponent)

Falson, Pierre (1958-....) (Membre du jury / opponent)

Université de Bordeaux (2014-....) (Organisme de soutenance / degree-grantor)

École doctorale Sciences de la vie et de la santé (Bordeaux) (Ecole doctorale associée à la thèse / doctoral school)

Chimie et Biologie des Membranes et des Nanoobjets (Bordeaux) (Laboratoire associé à la thèse / thesis associated laboratory)

Résumé / Abstract : L'utilisation d'antibiotiques pour lutter contre les infections bactériennes a favorisé l'émergence de souches résistantes. Comprendre les mécanismes de résistance est crucial pour lutter contre ces pathogènes. Cette thèse propose une étude structurale d'une pompe à efflux multidrogues de Pseudomonas aeruginosa qui se compose d'un transporteur MexB, d'une protéine canal OprM et d'une protéine adaptateur MexA. Les partenaires du complexe tripartite stabilisés en nanodisques ont permis la formation du complexe in vitro. L'optimisation des conditions de production du complexe a permis de cribler les différents paramètres régissant son assemblage. L'étude structurale par cryo-ME révèle un complexe de 30 nm de long en conformation de repos. L'étude de la stabilisation des protéines membranaires par nanodisques a conduit au développement d'un système minimal, débarrassé des lipides. Ce système minimal a révélé la nécessité d'une phase lipidique autour de MexB pour l'assemblage du complexe.

Résumé / Abstract : Antibiotics use against bacterial infections has led to the emergence of resistance. Understanding the mechanisms underlying resistance to antibiotics is critical to fight against these pathogens. This thesis presents a structural study of a multidrug efflux pump in Pseudomonas aeruginosa, composed of a transporter MexB, an exit duct OprM and an adaptor protein MexA. The proteins reconstituted in nanodiscs allowed tripartite complex formation in vitro. Optimization of yield led to the identification of key parameters governing complex assembly. Structural cryo-EM study revealed a 30 nm long complex in a resting state. The study of membrane protein stabilization by nanodisks led to the development of a minimal system devoid of lipids. This system showed a lipid phase around MexB is required for complex formation.