Transplantation pulmonaire et dysfonction chronique du greffon : caractérisation de biomarqueurs diagnostiques par analyse protéomique SELDI-TOF du liquide bronchiolo-alvéolaire / Sébastien Quétant ; sous la direction de Françoise Morel

Date :

Type : Livre / Book

Type : Thèse / Thesis

Langue / Language : anglais / English

Poumon -- Transplantation

Marqueurs biologiques

Protéomique

Transplantation pulmonaire -- Dissertation universitaire

Classification Dewey : 610

Morel, Françoise (1942-.... ; auteure en biologie) (Directeur de thèse / thesis advisor)

Pison, Christophe (1955-.... ; auteur en médecine) (Président du jury de soutenance / praeses)

Université Joseph Fourier (Grenoble ; 1971-2015) (Organisme de soutenance / degree-grantor)

Relation : Transplantation pulmonaire et dysfonction chronique du greffon : caractérisation de biomarqueurs diagnostiques par analyse protéomique SELDI-TOF du liquide bronchiolo-alvéolaire / Sébastien Quétant ; sous la direction de Françoise Morel / , 2009

Résumé / Abstract : Malgré les progrès récents réalisés en transplantation pulmonaire, le pronostic à long terme est compromis par la survenue d’une dysfonction chronique du greffon dont le diagnostic est basé sur le déclin de la fonction respiratoire. Nous avons analysé les profils protéiques du liquide de lavage bronchiolo-alvéolaire (LBA) de patients transplantés pulmonaires par une technologie protéomique innovante afin de caractériser des biomarqueurs diagnostiques de dysfonction chronique du greffon. Nous avons comparé de façon transversale le protéome des LBA de 13 patients avec un syndrome de bronchiolite oblitérante (groupe BOS), 21 patients avec une fonction pulmonaire stable (groupe ST) et 8 patients avec rejet aigu (groupe AR) par analyse protéomique SELDI-TOF (Surface Enhanced Laser Desorption/Ionization Time-Of-Flight). 45 pics d’intensité statistiquement différente ont été caractérisés entre le groupe BOS et ST, et 42 entre les groupes BOS et AR. Parmi les pics les plus discriminants, des biomarqueurs correspondant aux protéines S100 (10812Da, 10412Da et 13335Da, p<0,002) et aux alpha-défensines 1-3 (3354Da, 3424Da et 3470 Da, p<0,01) étaient surexprimés dans le groupe BOS. La protéine S100A8 (10812 Da) permet de différencier les patients BOS des patients stables avec une sensibilité de 92% et une spécificité de 72% (AUC=0.87) et les alpha-défensines présentent également une performance diagnostique importante. L’analyse protéomique du LBA par technique SELDI-TOF a permis de caractériser plusieurs biomarqueurs d’intérêt pour le diagnostic de dysfonction chronique du greffon et potentiellement impliqués dans sa physiopathologie : les protéines S100 et les alpha-défensines.

Résumé / Abstract : Objective: Despite progresses in lung transplantation, long-term prognosis is compromised by chronic allograft rejection. Its diagnosis is based on a delayed functional criterion and its physiopathology is still unclear. We investigated proteomic profiles of bronchoalveolar lavage fluid (BALF) of lung transplanted patients by an innovative proteomic technology in order to characterize diagnostic biomarkers of chronic allograft rejection. Methods: In a cross sectional pilot study, protein profiles of 13 lung transplant recipients with bronchiolitis obliterans syndrome (BOS), 21 patients with lung function stability (ST) and 8 patients with acute rejection (AR) were studied by SELDI-TOF MS (Surface Enhanced Laser Desorption Ionization Time-Of-Flight Mass Spectrometry) analysis. Results: Forty five differentially expressed proteins were detected in BOS group vs. ST population and forty two in BOS group vs. AR set. Among the most discriminating peaks, biomarkers corresponding to S100 proteins (10,812 Da, 10,412 Da and 13,335 Da, p<0.002) and alpha-defensins (3,354 Da, 3,424 Da and 3,470 Da, p<0.01) were up regulated in BOS patients compared to ST or AR patients. S100A8 protein (10,812 Da) discriminate BOS patients from ST patients with a sensitivity of 92% and a specificity of 72% (AUC=0.87), while alpha-defensins offer a slightly weaker diagnostic accuracy. Conclusion: BALF SELDI-TOF analysis allows detection of relevant biomarkers linked to BOS diagnosis and potentially involved in its physiopathology: S100 proteins and alpha-defensins.