Etudes par RMN de mécanismes de régulation de la biosynthèse de la paroi bactérienne / Nicolas Jean ; sous la direction de Jean-Pierre Simorre et de Catherine Bougault

Date :

Type : Livre / Book

Type : Thèse / Thesis

Langue / Language : français / French

Résonance magnétique nucléaire

Peptidoglycanes

Paroi bactérienne

Classification Dewey : 570

Simorre, Jean-Pierre (Directeur de thèse / thesis advisor)

Bougault, Catherine (19..-....) (Directeur de thèse / thesis advisor)

Imberty, Anne (1960-.... ; biochimiste) (Président du jury de soutenance / praeses)

Zinn-Justin, Sophie (19..-....) (Rapporteur de la thèse / thesis reporter)

Carballido-López, Rut (19..-....) (Rapporteur de la thèse / thesis reporter)

Vollmer, Waldemar (19..-....) (Membre du jury / opponent)

Grangeasse, Christophe (1971-....) (Membre du jury / opponent)

Communauté d'universités et d'établissements Université Grenoble Alpes (2015-2019) (Organisme de soutenance / degree-grantor)

École doctorale chimie et science du vivant (Grenoble ; 199.-....) (Ecole doctorale associée à la thèse / doctoral school)

Institut de biologie structurale (Grenoble) (Laboratoire associé à la thèse / thesis associated laboratory)

Résumé / Abstract : Le peptidoglycane est un biopolymère essentiel délimitant la bactérie et dont la synthèse est le produit de réactions catalysées par des complexes protéiques finement régulés spatio-temporellement. Le point culminant de ce processus est l'assemblage et l'insertion des chaînes réticulées de peptidoglycane dans la structure déjà existante par les PBPs, cibles des β-lactames. Les travaux présentées ici portent sur deux importants régulateurs peu caractérisés au niveau atomique, les Lpos (chez Escherichia coli), qui stimulent les activités des PBPs. En utilisant principalement la RMN, les premières structures à haute-résolution de ces protéines ont été obtenues et quelques interactions ont pu être étudiées. Les résultats présentés permettent de mieux comprendre comment ces facteurs, ancrés à la membrane externe, atteignent leur cible et régulent directement la synthèse du peptidoglycane.

Résumé / Abstract : Peptidoglycan is an essential biopolymer which surrounds the bacterial cell. Its biosynthesis is the product of large macromolecular complexes tightly regulated in space and time. The peak of this process is the assembly and insertion of peptidoglycan reticulated chains in the existing network by Penicillin-Binding Proteins (PBPs), targets of β-lactam antibiotics. The work presented here focuses on two important regulators of peptidoglycan growth lacking atomic-scale characterization, the Lpo proteins (in Escherichia coli). These proteins are directly stimulating PBPs activities. Using mainly NMR, their structure was obtained, for the first time, and, for one of them, the interaction with its protein partner was investigated. The results provide new insights on how these proteins reach their targets from the outer-membrane and on how their regulatory function is determined.