Modélisation des réarrangements V[alpha]-J[alpha] du TRA/TRD chez la souris et chez l'homme / Florence Thuderoz ; sous la direction de Jacques Demongeot

Date :

Type : Livre / Book

Type : Thèse / Thesis

Langue / Language : français / French

Recombinaison génétique

Demongeot, Jacques (1946-.... ; biomathématicien) (Directeur de thèse / thesis advisor)

Drouet, Christian (1954-.... ; auteur en biologie) (Président du jury de soutenance / praeses)

Auffray, Charles (19..-....) (Rapporteur de la thèse / thesis reporter)

Merkenshlager, Matthias (19..-.... ; biologiste) (Rapporteur de la thèse / thesis reporter)

Lefranc, Marie-Paule (19..-....) (Membre du jury / opponent)

Marche, Patrice (19..-....) (Membre du jury / opponent)

Université Joseph Fourier (Grenoble ; 1971-2015) (Organisme de soutenance / degree-grantor)

École doctorale ingénierie pour la santé, la cognition, l'environnement (Grenoble ; 1995-....) (Ecole doctorale associée à la thèse / doctoral school)

Techniques de l’ingénierie médicale et de la complexité - Informatique, mathématiques et applications (Grenoble) (Laboratoire associé à la thèse / thesis associated laboratory)

Relation : Modélisation des réarrangements V[alpha]-J[alpha] du TRA/TRD chez la souris et chez l'homme / Florence Thuderoz ; sous la direction de Jacques Demongeot / Villeurbanne : CCSD , 2016

Relation : Modélisation des réarrangements V[alpha]-J[alpha] du TRA/TRD chez la souris et chez l'homme / Florence Thuderoz ; sous la direction de Jacques Demongeot / Lille : Atelier national de reproduction des thèses , 2010

Résumé / Abstract : La recombinaison V(D)J constitue une recombinaison somatique et site-spécifique de l'ADN à l'origine de la diversité des récepteurs antigéniques des lymphocytes T chez les vertébrés mandibulés. Concernant la chaîne a des récepteurs T, les gènes V et J sont utilisés depuis l'intérieur du locus TRA vers les gènes distauxdurant des réarrangements successifs et ce sans exclusion allélique. La quantification expérimentale de certaines associations V -J chez la souris a permis de définir les tendances des répertoires combinatoires thymiques et périphériques. Un modèle numérique stochastique, basé sur des fenêtrages d'ouverture successives progressant sur les régions V et J durant les cycles de réarrangements, a permis une meilleure compréhension des règles dynamiques gouvernant les réarrangements V -J et a apporté la connaissance d'un répertoire combinatoire simulé renseignant les fréquences de toutes les associations V-Jo Lors de la transition à l'homme, la quantification des associations V -J a été réalisée au niveau du thymus, constituant un premier échantillonnage à large échelle du répertoire combinatoire TRA humain. L'étape de modélisation a offert une compréhension claire de la construction dynamique du répertoire a humain et a permis de proposer des prédictions sur la diversité du répertoire combinatoire. Finalement, la progression de l'accessibilité des gènes aux réarrangements selon des vitesses d'ouverture non-constantes associée à une ouverture synchronisée des régions J entre les deux allèles se sont révélées suffisantes pour expliquer les fréquences V -J expérimentales présentement disponibles pour les deux espèces ainsi que l'utilisation interallélique des gènes J.