Développement d'outils chimiques pour l'étude de la voie rétrograde : synthèse totale du glycosphingolipide GB3 et protéomique de la voie rétrograde / Romain Christiano ; [sous la direction de] Jean-Claude Florent

Date :

Editeur / Publisher : [S.l.] : [s.n.] , 2009

Type : Livre / Book

Type : Thèse / Thesis

Langue / Language : français / French

Cellules -- Interaction

Transport biologique

Glycosphingolipides

Shiga-toxine -- Dissertation universitaire

Florent, Jean-Claude (Directeur de thèse / thesis advisor)

Université Paris Descartes (1970-2019) (Organisme de soutenance / degree-grantor)

Université Paris Descartes. Faculté de pharmacie de Paris (....-2019) (Autre partenaire associé à la thèse / thesis associated third party)

École doctorale du Médicament (....-2009 ; Paris) (Ecole doctorale associée à la thèse / doctoral school)

Relation : Développement d'outils chimiques pour l'étude de la voie rétrograde : synthèse totale du glycosphingolipide GB3 et protéomique de la voie rétrograde / Romain Christiano ; [sous la direction de] Jean-Claude Florent / Lille : Atelier national de reproduction des thèses , 2009

Résumé / Abstract : L’étude du trafic intracellulaire représente un vaste champ d’investigation dans le domaine de la biologie cellulaire. Plus particulièrement, l’élucidation des processus biologiques permettant aux molécules d’entrer dans les cellules ainsi que les différents mécanismes permettant leur transport jusqu’à leur cibles intracellulaires représente un intérêt majeur tant dans le domaine des connaissances fondamentales que thérapeutiques. C’est dans ce contexte que ce projet de thèse s’inscrit. Par une approche plaçant la chimie organique au cœur de la recherche en biologie cellulaire, divers outils chimiques dédiés à l’approfondissement des connaissances sur la voie de transport rétrograde et l’endocytose indépendante de la clathrine ont été synthétisés. D’une part, une sonde peptidique amino-réactive – bSuPeR - a été préparée pour le profilage dynamique des protéines qui suivent la voie de transport rétrograde. Le traitement de cellules en culture avec bSuPeR a permis de valider le concept de profilage dynamique sur une protéine rétrograde modèle : la sous-unité B de la toxine de Shiga (STxB). D’autre part, différentes isoformes du récepteur de STxB : le glycosphingolipide globotriaosylcéramide (Gb3) ont été obtenus par synthèse totale pour l’étude de l’endocytose, de STxB, indépendante de la clathrine

Résumé / Abstract : The integrated analysis of intracellular trafficking pathways is one of the current challenges in the field of cell biology. Moreover, elucidation of either biological processes that allow molecules to enter into cells or mechanisms involved in their specific transport to reach their intracellular target is of critical importance for basic as well as therapeutic research. This present manuscript deals directly with this topic. Using chemistry as the core of our research, several chemical tools dedicated to the extending of our knowledge about retrograde transport and clathrin-independent pathway were synthesized. On one hand; a peptidic amino-reactive probe - SuPeR - was prepared for the traffic-based profiling of proteins that follow the retrograde route within the cells. Cell surface modification of bSuPeR-treated cells allowed us to validate the dynamic traffic-based profiling using a known retrograde cargo protein: the B-subunit of Shiga toxin (STxB). On the other hand, several isoforms of STxB cellular receptor ﷓ the glycosphingolipid Gb3 – were synthesized by total synthesis to study STxB clathrin-independent endocytosis