Approches bioinformatiques et structurales des réplicases virales / François-Patrice Ferron ; sous la dir. du Dr Bruno Canard

Date :

Type : Livre / Book

Type : Thèse / Thesis

Langue / Language : français / French

Langue / Language : anglais / English

Bioinformatique

Virologie

Coronaviridés

Bases de données

Canard, Bruno (1962-.... ; directeur de recherche en biologie) (Directeur de thèse / thesis advisor)

Université d'Aix-Marseille II. Faculté des sciences (1969-2011) (Autre partenaire associé à la thèse / thesis associated third party)

Ecole Doctorale Sciences de la Vie et de la Santé (Marseille) (Ecole doctorale associée à la thèse / doctoral school)

Université Aix-Marseille II (1969-2011) (Organisme de soutenance / degree-grantor)

Relation : Approches bioinformatiques et structurales des réplicases virales / François-Patrice Ferron / Villeurbanne : [CCSD] , 2005

Relation : Approches bioinformatiques et structurales des réplicases virales / François-Patrice Ferron ; sous la direction du Dr Bruno Canard / Grenoble : Atelier national de reproduction des thèses , 2005

Résumé / Abstract : La virologie bénéficie de plus en plus du développement de la bioinformatique. Mon projet de thèse recouvre la gestion de séquences de protéines se rapportant aux virus à ARN simple brin, de polarité négative et positive. J'ai mis en place une base de données VaZyMolO, qui gère les informations structurales et fonctionnelles des protéines, en définissant et en classant des modules. Cette approche a permis l'identification d'un domaine méthyltransférase sur la protéine L des Mononegavirales, et la définition de la modularité des protéines N et P des Paramyxoviridae. La cartographie du génome du virus du Syndrome Respiratoire Aigue Sévère réalisée à l'aide de VaZyMolO, a contribué à la résolution structurale de la protéine nsp9 de ce virus. Enfin, je présente une étude incluant évolution et analyse structurale des polymérases des Flaviviridae. Dans cette dernière, je propose un modèle de la polymérase du virus GBV-C et un mécanisme d'initiation de la synthèse d'ARN.