Remodelage de la chromatine : étude d'un mutant du complexe RSC chez la levure Saccharomyces cerevisiae / par Véronique Bordas-Le Floch ; sous la direction de Michel Werner

Date : 2002

Editeur / Publisher : [S.l.] : [s.n.] , 2002

Type : Livre / Book

Langue / Language : français / French

Werner, Michel (Directeur de thèse / thesis advisor)

Institut national agronomique Paris-Grignon (1971-2006) (Organisme de soutenance / degree-grantor)

Relation : Remodelage de la chromatine : étude d'un mutant du complexe RSC chez la levure Saccharomyces cerevisiae / par Véronique Bordas-Le Floch / Villeurbanne : [CCSD] , 2004

Relation : Remodelage de la chromatine : étude d'un mutant du complexe RSC chez la levure Saccharomyces cerevisiae / par Véronique Bordas-Le Floch ; sous la direction de Michel Werner / Grenoble : Atelier national de reproduction des thèses , 2002

Résumé / Abstract : Le complexe RSC est un des facteurs de remodelage de la chromatine capables de lever la barrière nucléosomale notamment lors de la transcription. Ce processus est effectué chez les eucaryotes par trois ARN polymérases (pol). Nous avons montré que le complexe RSC interagit avec les pol I et III. La protéine Rsc4 interagit par son domaine C-terminal avec la protéine ABC27, commune aux trois ARN polymérases. Nous avons isolé une mutation de la sous-unité Rsc4 qui abolit cette interaction. Les profils d'expression génomiques, établis par puces à ADN, ont permis de caractériser ses effets sur la transcription par la pol II. Curieusement, la majorité des gènes induits sont répartis sur le chromosome XII de manière non polaire. La présence de l'ADN ribosomique sur ce chromosome suggère un lien avec ce comportement particulier. Par ailleurs, la maturation de l'ARN 35S, transcrit par la pol I, est altérée, mais nous n'avons pas pu caractériser des défauts de transcription par les pol I et III.

Résumé / Abstract : The RSC complex is one of the chromatin remodeling complexes that helps the transcripiton machinery to overcome the nucleosomal barrier. Eukaryotic transcription is carried out by three RNA polymerases. We have demonstrated that RSC complex interacts with pol I and III. The Rsc4 protein interacts by its C-teminal domain with the ABC27 protein, a subunit shared by the three eukaryotic RNA polymerases, We have isolated a mutation in the Rsc4 subunit that ablolish thi interaction. We performed genome profiling experiments using DNA microarrays to characterise pol II transcription defects. Surprisingly, the vast majority of the upregulated genes localised to the chromosome XII, spreading all along in a non-polar manner. We propose that the presence of the rDNA cluster on chromosome XII could be responsible for this peculiar transcriptional pattern. We have seen defects in the 35S RNA maturation but have been unable to clearly establish defects on pol I and pol III transcription.