MODELISATION MOLECULAIRE DE LA RECONNAISSANCE DE L'ADN PAR DES OLIGODESOXYRIBONUCLEOTIDES FONCTIONNALISES FORMANT DES TRIPLES HELICES ET PAR LA NETROPSINE-FLAVINE / CHRISTOPHE KETTERLE ; SOUS LA DIRECTION DE M. LEBRET

Date :

Editeur / Publisher : [S.l.] : [s.n.] , 1995

Format : 165 P.

Type : Livre / Book

Type : Thèse / Thesis

Langue / Language : français / French

Lebret, Marc (19..-....) (Directeur de thèse / thesis advisor)

Université Paris-Sud (1970-2019) (Organisme de soutenance / degree-grantor)

Relation : MODELISATION MOLECULAIRE DE LA RECONNAISSANCE DE L'ADN PAR DES OLIGODESOXYRIBONUCLEOTIDES FONCTIONNALISES FORMANT DES TRIPLES HELICES ET PAR LA NETROPSINE-FLAVINE / Christophe Ketterle ; sous la direction de M. Lebret / Grenoble : Atelier national de reproduction des thèses , 1995

Résumé / Abstract : NOUS AVONS CONSTRUIT UNE BASE DE DONNEES STRUCTURALE DE TRENTE-DEUX TRIPLETS D'APRES DES DONNEES PHYSICOCHIMIQUES, ET ETUDIE PAR MODELISATION MOLECULAIRE LA RECONNAISSANCE SPECIFIQUE DE L'ADN PAR DEUX MOLECULES HYBRIDES. LA PREMIERE MOLECULE EST COMPOSEE D'UN DESOXYRINUCLEOTIDE (ODN) 5'GGGAAGG, FORMANT UNE TRIPLE HELICE D'ADN, ET DE L'AGENT INTERCALANT OXAZOLOPYRIDOCARBAZOLE (OPC). NOUS AVONS UTILISE NOTRE BASE DE DONNEES DE TRIPLETS POUR ETUDIER PAR MECANIQUE ET DYNAMIQUE MOLECULAIRE QUATRE TRIPLES HELICES HOMOGENES ET LE COMPLEXE ODN-OPC D(GGAAGGGCTAAT). LE SITE D'INTERCALATION DE L'OPC LE PLUS FAVORABLE A ETE TROUVE A LA JONCTION TRIPLEX-DUPLEX. LA SECONDE MOLECULE (NET-FLA) EST COMPOSEE D'UNE NETROPSINE PRIVEE DE SON GUANIDINIUM RELIEE A UN GROUPEMENT FLAVINIQUE. NOUS AVONS ETUDIE LA FIXATION DE NET-FLA DANS LE PETIT SILLON DE QUATRE 14-MER D'ADN RICHES EN ADENINES ET EN THYMINES. NET-FLA SE LIE A DES SITES ASYMETRIQUES DANS UNE SEULE ORIENTATION, ET A DES SITES SYMETRIQUES OU HOMOGENES DANS LES DEUX ORIENTATIONS. NOUS AVONS EFFECTUE UNE SIMULATION PAR DYNAMIQUE MOLECULAIRE EN MILIEU AQUEUX EXPLICITE SUR LE COMPLEXE NET-FLA D(TCCAGAAATCGGAC) QUI SUGGERE QUE DES MOLECULES D'EAU RENFORCENT LA FIXATION DE NET-FLA SUR L'ADN EN PONTANT LES DEUX MOLECULES. LORS DE CETTE SIMULATION, LES FONCTIONS D'AUTOCORRELATION TEMPORELLE SUR LES PARAMETRES HELICOIDAUX DE L'ADN PRESENTENT UN MODE RAPIDE SIMILAIRE A CELUI OBSERVE DANS LE VIDE, SUIVIE D'UN MODE PLUS LENT