Structure et évolution de l'ARN ribosomique 24-26S des Protistes : application à la phylogénie des Dinoflagellés (Pyrrhophytes) / par Guy Lenaers ; sous la direction de Michel Herzog

Résumé / Abstract : L'ARN RIBOSOMIQUE 24-28S REPRESENTE L'UN DES MARQUEURS PHYLOGENETIQUES LES PLUS PERFORMANT, IL EST ETUDIE CHEZ LES PROTISTES ET EN PARTICULIER CHEZ LES DINOFLAGELLES ET CILIES. CETTE MOLECULE PRESENTE UN CUR CONSERVE DE QUELQUES 1900 NUCLEOTIDES DONT LA STRUCTURE SECONDAIRE SEMBLE UNIVERSELLE, ENTRECOUPE DE 12 DOMAINES DIVERGENTS POUR LESQUELS NOUS AVONS REDEFINI LES MODELES DE CONFORMATION AU SEIN DES PROTISTES. LA COMPARAISON DES 1900 NT DU CUR CONSERVE CHEZ LES PROTISTES ET EUCARYOTES SUPERIEURS A PERMIS D'ETABLIR LA PROXIMITE PHYLOGENETIQUE DES DINOFLAGELLES, CILIES ET LEVURES. GRACE A L'UTILISATION DE LA METHODE DE SEQUENCAGE DIRECTE DE L'ARN PAR LA REVERSE-TRANSCRIPTASE, NOUS AVONS DETERMINE LA SEQUENCE DES DOMAINES D1 ET D8 DE L'ARNR 24S DE 13 ESPECES DINOFLAGELLES. LA PHYLOGENIE DEDUITE INDIQUE QUE LES OXYRRHINALES REPRESENTENT LA PLUS ANCIENNE LIGNEE DES DINOFLAGELLES ACTUELS. LES PERIDINIALES EMERGENT ENSUITE ET SON POLYPHYLETIQUES. ENFIN, L'EMERGENCE TARDIVE ET LA PROXIMITE PHYLOGENETIQUE DES GYMNODINIALES ET PROROCENTRALES CONTREDIT TOUS LES MODELES FONDES SUR LES DONNEES BIOLOGIQUES ET PALEONTOLOGIQUES. LA POSITION NON ALEATOIRE D'UNE COUPURE OBSERVEE DANS LE DOMAINE DIVERGENT D2 POUR 11 DES 13 ESPECES ETUDIEES, CONFIRME CETTE PHYLOGENIE DANS CES GRANDES LIGNES. L'ANALYSE DES CORRESPONDANCES, METHODE MATHEMATIQUE D'ANALYSE FACTORIELLE, A ETE TESTEE ET S'AVERE ETRE UN OUTIL PUISSANT DE DISSECTION DE L'INFORMATION CONTENUE DANS LA SEQUENCE DE MACROMOLECULES, A DES FINS PHYLOGENETIQUES